Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka5Q8C050 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka5Q8C050 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms