Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR2Q16832 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR2Q16832 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR2Q16832 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms