Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms