Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUCB1Q02818 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms