Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms