Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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