Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms