Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms