Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUX4Q9UBX2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms