Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms