Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCSTNQ92542 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms