Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDCSPQ8NFU4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDCSPQ8NFU4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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