Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms