Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms