Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms