Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gabpb1Q00420 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gabpb1Q00420 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gabpb1Q00420 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gabpb1Q00420 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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