Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccrl2O35457 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms