Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn5Q9WVD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcn5Q9WVD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms