Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms