Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx6Q9R1R0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhx6Q9R1R0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms