Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPTLC3Q9NUV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms