Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms