Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ropn1lQ9EQ00 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms