Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SyncQ9EPM5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SyncQ9EPM5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SyncQ9EPM5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms