Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3fQ9DCH4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms