Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtf2e2Q9D902 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e2Q9D902 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e2Q9D902 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms