Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nop56Q9D6Z1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop56Q9D6Z1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms