Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rabl3Q9D4V7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rabl3Q9D4V7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms