Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp1Q9CYR0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms