Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CXL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CXL3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CXL3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CXL3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CXL3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q9CXL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CXL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CXL3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CXL3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms