Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smc3Q9CW03 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc3Q9CW03 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc3Q9CW03 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms