Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2310003L06RikQ9CV82 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
2310003L06RikQ9CV82 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310003L06RikQ9CV82 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms