Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931417E11RikQ9CR05 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms