Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930519G04RikQ9CPT7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930519G04RikQ9CPT7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms