Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nsmce3Q9CPR8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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