Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bap1Q99PU7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bap1Q99PU7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bap1Q99PU7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms