Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nus1Q99LJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms