Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpifQ99KR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms