Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms