Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf144aQ925F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf144aQ925F3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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