Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SptssbQ925E8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SptssbQ925E8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SptssbQ925E8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms