Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncbQ91ZZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncbQ91ZZ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms