Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI51

Sorcs3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs3Q8VI51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms