Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrit1Q8K099 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrit1Q8K099 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrit1Q8K099 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrit1Q8K099 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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