Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cracr2bQ80ZJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2bQ80ZJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms