Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip1Q7TMB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip1Q7TMB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip1Q7TMB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms