Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc4Q6P2L7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc4Q6P2L7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc4Q6P2L7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.5 ms