Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Kcnc3Q63959 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
Kcnc3Q63959 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Kcnc3Q63959 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Kcnc3Q63959 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Kcnc3Q63959 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Kcnc3Q63959 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms