Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema4bQ62179 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4bQ62179 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms