Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phox2aQ62066 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phox2aQ62066 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phox2aQ62066 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms