Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkn2dQ60773 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2dQ60773 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2dQ60773 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 827.6 ms